纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1的筛选及基因组测序

作     者：唐昊 孙灿 李沅秋 罗朝兵 TANG Hao;SUN Can;LI Yuan-qiu;LUO Chao-bing

作者机构：乐山师范学院生命科学学院乐山614000 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2021年第37卷第6期

页      面：85-96页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：四川省科技计划项目(2019YFG0139) 竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室开放项目(17ZL007、ZLKF1902) 乐山师范学院人才引进项目(XJR19001) 

主　　题：Raoultella ornithinolytica LL1 纤维素降解 基因组测序 纤维素酶 

摘      要：纤维素作为一种资源丰富的天然聚合物,可被微生物降解为可溶性糖,因此筛选高效纤维素降解菌备受关注。本研究利用CMC选择培养基筛选出一株纤维素降解菌Raoultella ornithinolytica LL1,采用三代Pacbio Sequl和二代Illumina Novaseq平台进行基因组测序,并采用DNS法测定其纤维素酶活。*** LL1基因组大小为5584354 bp,包含5512个基因,其中NR、Swiss-Prot、Pfam、COG、GO、KEGG和CAZyme数据库中分别注释有5511、4419、4584、4745、3610、3336和128个基因,同时基因组注释有大量木质纤维素降解相关基因。*** LL1具有较高的纤维素酶活性,其中β-葡萄糖苷酶活性最高,其次是内切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶活性最低。本研究通过基因组测序及酶活测定揭示了*** LL1降解纤维素的能力,为其降解纤维素及进一步纤维素转化奠定了基础。