基于转录组测序的火龙果果肉不同发育时期淀粉和蔗糖代谢途径相关基因差异表达分析

作     者：杨运良 李建勋 马革农 YANG Yunliang;LI Jianxun;MA Genong

作者机构：山西农业大学棉花研究所山西运城044000 

出 版 物：《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期：2021年第42卷第6期

页      面：1520-1530页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：山西省科技厅面上青年基金项目(No.201701D221204) 山西省农业科学院特色农业技术攻关项目(No.YGG17050) 农业科技成果转化与示范推广项目(No.2020CGZH03-01) 

主　　题：火龙果 果肉 转录组测序 淀粉 蔗糖 

摘      要：采用Illumina Novaseq 6000测序技术对火龙果果肉3个时期(幼果期、转色期、成熟期)的样品进行转录组测序,对获得的Unigene进行7大数据库注释,共有3617个Unigene成功注释在所有数据库中,进一步筛选与淀粉和蔗糖代谢途径相关的5个酶基因并进行实时荧光定量PCR(qPCR)基因表达验证。结果表明:转录组测序共得到115193条转录本和47855条Unigene,N50为2000。GO功能富集分析结果表明,18582个Unigene在GO功能注释中被分为生物过程、细胞组成及分子功能3大类。KOG功能分类结果表明,6203个Unigene在KOG注释中被分为25个组,其中翻译后修饰、蛋白质周转、伴侣包含的Unigene最多,共854个。KEGG代谢通路注释结果表明,6554个Unigene获得功能注释,共有119条代谢途径,其中碳水化合物代谢所占比例最高。筛选出UGP2、glgC、glgA、Cluster-12747.5831、Cluster-12747.16617等5个参与淀粉和蔗糖代谢合成途径的关键酶基因,qPCR检测表达水平与转录组测序结果一致。