利用转录组学分析三峡肽素生物合成的基因簇

作     者：刘超 李坤 白晓轩 杨宇纯 薛艳红 刘士平 LIU Chao;LI Kun;BAI Xiaoxuan;YANG Yuchun;XUE Yanhong;LIU Shiping

作者机构：三峡大学生物与制药学院中国轻工业功能酵母重点实验室湖北宜昌443002 

出 版 物：《食品工业科技》 (Science and Technology of Food Industry)

年 卷 期：2021年第42卷第13期

页      面：156-162页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31270389 31540065) 

主　　题：草酸青霉 三峡肽素 柑橘 生物合成 转录组 基因簇 

摘      要：为了分析三峡肽素(Sanxiapeptin)生物合成途径,本文采用BGISEQ-500平台测定了SG-4在200 mL培养4、7 d及300 mL培养7 d时c DNA文库,并对高通量测序产生的6.42 Gb序列数据进行了无参转录组分析。结果表明,转录组序列比对率高达93.88%,差异基因主要集中在抗生素合成、物质转运及氧化还原代谢等途径,在非核糖体肽合成酶(NRPS,Non-ribosomal peptide synthetase)基因簇PDE_01071中,21个基因的表达趋势与物质的含量完全吻合,暗示其可能参与了三峡肽素的合成。