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不同植物防御素的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of Defensins in Different Plants

作     者:王汉屏 WANG Han-Ping

作者机构:陕西教育学院生命科学系西安710061 

出 版 物:《植物生理学通讯》 (Plant Physiology Communications)

年 卷 期:2008年第44卷第1期

页      面:25-32页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 07[理学] 09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基  金:陕西教育学院重点科研项目(06KJ013) 

主  题:植物防御素 生物信息学 核酸 氨基酸 序列分析 信号肽 

摘      要:采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的花生、鹰嘴豆、合欢、车前草、沙梨、辣椒等植物的防御素的核酸和氨基酸序列作了分析,并对其组成成分、翻译后修饰、导肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构和功能结构域进行预测和推断的结果表明:此类蛋白可能是一具有信号肽的分泌型蛋白,α-螺旋和不规则卷曲是蛋白质二级结构中量最大的结构元件,β-转角和延伸链散布于整个蛋白质中,包含一个gamma-thionin功能结构域。

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