木瓜转录组数据SSR标记的开发及其遗传多样性分析

作     者：伍越 王甜甜 李泽秀 纪庆柱 毛培利 诸葛绪钦 曹帮华 WU Yue;WANG Tiantian;LI Zexiu;JI Qingzhu;MAO Peili;ZHUGE Xuqin;CAO Banghua

作者机构：山东农业大学林学院山东泰安271018 东营市园林绿化中心山东东营257091 临沂市多维木瓜饮品有限公司山东临沂276026 北京林木分子设计育种高精尖创新中心/林木育种国家工程实验室/北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 

出 版 物：《植物生理学报》 (Plant Physiology Journal)

年 卷 期：2021年第57卷第4期

页      面：847-861页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：山东省林业科技创新项目(2019LY00104和LYCX02-2018-12) 山东省重大科技创新工程(2017CXGC0316) 山东省农业应用技术创新课题“良种木瓜高产优质和加工利用提升技术”。 

主　　题：木瓜 转录组 SSR 遗传多样性 

摘      要：试验对木瓜属(Chaenomeles)58份种质进行遗传多样性研究,为木瓜种质资源鉴定与遗传改良提供了参考。基于皱皮木瓜‘长俊’和光皮木瓜‘豆青’转录组测序数据进行简单重复序列标记(SSR)位点检测,利用毛细管电泳法进行荧光SSR-PCR产物检测。结果表明:共筛选出22对EST-SSR多态性标记,在58份木瓜资源中扩增检测出平均多态性条带(NPB)6.95个、等位基因数(Na)为5.64、有效等位基因数(Ne)为3.76、Shannon’s信息指数(I)为1.3955、Nei’s基因多样性指数(H)为0.8404和多态性信息含量(PIC)为0.6327。群体结构、聚类及主成分分析表明,58份木瓜种质划分为5个亚群,遗传相似系数在0.58~0.95之间,光皮木瓜、日本木瓜显著区分,毛叶木瓜和西藏木瓜的亲缘关系最近,与皱皮木瓜的亲缘关系次之。