基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析

作     者：代小冬 朱灿灿 宋迎辉 王春义 代书桃 秦娜 李君霞 DAI Xiaodong;ZHU Cancan;SONG Yinghui;WANG Chunyi;DAI Shutao;QIN Na;LI Junxia

作者机构：河南省农业科学院粮食作物研究所河南郑州450002 

出 版 物：《核农学报》 (Journal of Nuclear Agricultural Sciences)

年 卷 期：2021年第35卷第8期

页      面：1761-1770页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家自然科学基金(U1504314) 国家现代农业产业技术体系专项资金项目(nycytx-CARS-06) 

主　　题：谷子 萌芽期 抗旱性 RNA-seq 

摘      要：为了明确响应干旱胁迫的关键基因,解析谷子抗旱机制,本研究以谷子抗旱品种山西2010和干旱敏感品种K359*M4-1为材料,应用RNA-seq技术对两个品种干旱胁迫前后萌发期种子进行转录组测定。结果表明,在山西2010和K359*M4-1中分别鉴定出2 300个和3 652个差异表达基因(DEG),包括编码类锌诱导的促进因子、类萌发素蛋白、蛋白磷酸化酶、转运蛋白、胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)、转录因子、过氧化物酶等基因。通过对鉴定到的DEG进行GO和KEGG代谢途径富集分析,发现山西2010和K359*M4-1中的DEG分别富集在52个和21个生物学过程。KEGG富集分析发现,DEG主要富集在淀粉和蔗糖代谢,植物激素信号转导,光合作用-天线蛋白,苯丙素生物合成,角质、亚氨酸和蜡生物合成,次生代谢物生物合成等途径。本研究结果为挖掘谷子抗旱关键基因、解析谷子抗旱机制奠定了基础。