基于生物信息学方法分析心肌梗死大鼠miRNA芯片

作     者：姚道敏 谢亮 宫剑滨 朱静 刘晶 YAO Dao-min;XIE Liang;GONG Jian-bin;ZHU Jing;LIU Jing

作者机构：南京中医药大学药学院江苏南京210023 南京大学医学院附属金陵医院心脏内科江苏南京210000 

出 版 物：《中国药理学通报》 (Chinese Pharmacological Bulletin)

年 卷 期：2021年第37卷第5期

页      面：673-680页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金面上资助项目(No 81773963) 

主　　题：心肌梗死 MicroRNA long non-coding RNA mRNA 表达谱 生物信息学 

摘      要：目的筛选大鼠梗死心肌组织microarray芯片中差异表达的miRNA,预测其互作lncRNA和靶基因,探索心肌梗死潜在的病理机制。方法结扎左前降支冠状动脉建立大鼠心梗模型。应用TRIzol法提取梗死左心室心肌区总RNA进行芯片检测。用生物信息学方法找出可能存在的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果19个明显差异表达的miRNAs中8个miRNAs(miR-21、miR-132、miR-222、miR-223-3p、miR-146a/b、miR-181b、miR-449a-5p、miR-122)已被证明是治疗心梗的候选分子,7个miRNAs(miR-365-5p、miR-490-5p、miR-6333、miR-30c-1-3p、miR-3591、miR-3596c、miR-877)是否与心肌梗死有关未知。心肌梗死发生发展中可能存在几条新的lncRNA-miRNA-mRNA作用机制。ENSRNOT00000076620-miR-146b-5p-STAT3/Rnf7/Qrsl1可能参与梗死心肌细胞的凋亡和线粒体损伤过程。ENSRNOT00000071991-miR-122-Deptor可能抑制心肌细胞自噬的发生,加剧心肌梗死的过程。NR_132625-miR-21-3P/miR-18a-5p-Coq5/Acsl1/Tmem65可能参与心肌梗死线粒体损伤过程。结论通过心肌梗死大鼠miRNA芯片分析得到的lncRNA-miRNA-mRNA三元关系,为深入研究心肌梗死分子水平的病理机制,揭示相关药物作用机制以及寻找治疗新靶标提供方向和理论依据。