铝处理下绣球实时荧光定量PCR内参基因筛选及验证
Selection and Validation of Reference Genes for qRT-PCR Gene Expression Analysis in Hydrangea macrophylla under Aluminum Treatment作者机构:江苏省农业科学院休闲农业研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室江苏南京210014 江苏大学生命科学学院江苏镇江212013 南京农业大学园艺学院江苏南京210014
出 版 物:《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)
年 卷 期:2021年第36卷第2期
页 面:9-18页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:国家自然科学基金项目(31901359) 江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划项目(ZX(17)2004) 江苏省昆山市科技项目(KN1809)
摘 要:为筛选适合铝处理下绣球中稳定表达的内参基因,在转录组数据分析的基础上,以Al2(SO4)3处理下绣球铝敏感品种Bailer(商品名:Endless SummerTM,中文名译为无尽夏)和不敏感品种Ruby(中文名译为红宝石)的不同组织为材料,分析10个候选内参基因(5个传统内参基因和5个新基因)的表达水平,并利用geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCt及RefFinder 5个程序分析候选内参基因的表达稳定性。结果表明,β-TUB(β-微管蛋白)和UPL7(E3泛素蛋白连接酶)的表达水平较高,而且相对较稳定;表达稳定性分析结果显示,在Al2(SO4)3处理下Bailer中最适内参基因为UPL7和β-TUB,其次是ACT7,Ruby中最适内参基因为β-TUB和UBP15,其次是UPL7;适用于不同组织器官以及所有样本的最适内参基因同样为β-TUB、UBP15和UPL7。因此,β-TUB和UPL7为铝处理下绣球实时荧光定量PCR最适内参基因;以β-TUB、UPL7和β-TUB+UPL7作为内参基因时,绣球铝转运蛋白基因HmVALT的表达模式一致。