拟南芥ECT7蛋白的相互作用蛋白及翻译后修饰的鉴定
Identification of ECT7-interacting proteins and post-translational modifications of ECT7 protein in Arabidopsis作者机构:福建农林大学生命科学学院福州350002
出 版 物:《植物生理学报》 (Plant Physiology Journal)
年 卷 期:2021年第57卷第3期
页 面:605-613页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种]
主 题:拟南芥 ECT7 m6A读码器 RNA结合蛋白 基于同位素标记的定量免疫沉淀-质谱联用(SILIP-MS)
摘 要:Evolutionarily conserved C-terminal region (ECT)蛋白是植物中的一类RNA结合蛋白,负责识别RNA的6-甲基腺嘌呤(N6-methyl-adenosine, m6A)修饰。m6A结合蛋白被报道在动物体的生命活动及发育过程中起重要调控作用,而植物中ECT家族仅有少量报道且具体功能及工作机制尚不清楚,亟待研究。本文利用基于稳定同位素标记的定量蛋白质组学方法鉴定了ECT7蛋白的相互作用蛋白及翻译后修饰,共鉴定到45个ECT7的相互作用蛋白,其中包括其自身和同源蛋白ECT8 (evolutionarily conserved C-terminal region8)在内的5个RNA结合蛋白,并利用酵母双杂交实验对ECT家族蛋白之间进行了互作验证,发现ECT7可与多个ECT家族成员相互作用。不仅如此,还鉴定到ECT7蛋白有4个氧连-氮乙酰葡萄糖胺(O-linkedβ-N-acetyl glucosamine, O-GlcNAc)修饰位点和4个磷酸化修饰位点。研究结果对于进一步研究ECT7蛋白的功能及其识别m6A修饰的分子机制提供了理论依据。