温带臭虫细胞色素P450 CYP4C1蛋白生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of CYP4C1 Protein in Cytochrome P450 of Cimex lectularius作者机构:太原师范学院生物系山西晋中030619 山西省疾病预防控制中心病媒生物防控科山西太原030012
出 版 物:《安徽农学通报》 (Anhui Agricultural Science Bulletin)
年 卷 期:2021年第27卷第7期
页 面:18-22,64页
学科分类:1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金(No.31501840) 山西省高等学校科技创新项目(No.2020L0511) 山西省大学生创新创业项目(No.2020503) 太原师范学院青年学术带头人资助项目
摘 要:为阐明CYP4家族基因在温带臭虫(Cimex lectularius)解毒代谢机制中的作用,应用生物信息学软件对温带臭虫CYP4C1蛋白的结构与生物学特性进行预测和分析。通过GenBank数据库获得温带臭虫CYP4C1基因与CYP4C1蛋白序列信息,利用生物信息学软件对CYP4C1基因、CYP4C1蛋白进行分析;并构建系统发育树。结果表明,温带臭虫CYP4C1的cDNA编码区全长为1053bp,编码500个氨基酸;第5~23位氨基酸为疏水区;不稳定指数为37.85;在5~27位氨基酸之间形成1个典型的跨膜区;无信号肽结构;亚细胞定位在细胞质中;具19个磷酸化位点,3个糖基化位点以及4个N-酰基化位点;二级结构预测显示,主要结构元件为α-螺旋和无规卷曲;含3个二硫键;含P450结构功能域。