口腔白斑病癌变相关缺氧应答基因和微小RNA的芯片检测及表达验证
Transcriptome array screening and verification of oral leukoplakia carcinogenesis-related hypoxia-responsive gene and microRNA作者机构:上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔黏膜病科国家口腔疾病临床研究中心上海市口腔医学重点实验室/上海市口腔医学研究所上海200011 上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔颌面头颈肿瘤科上海200011 江南大学附属医院(第三人民医院)口腔科无锡214000
出 版 物:《华西口腔医学杂志》 (West China Journal of Stomatology)
年 卷 期:2021年第39卷第1期
页 面:20-25页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金(82074502) 四川大学口腔疾病研究国家重点实验室开放课题(SKLOD2020OF08)
摘 要:目的探讨口腔白斑病癌变进程中的缺氧应答基因及相关微小RNA(miRNA)的表达。方法利用Affymetrix GeneChip人转录组芯片(HTA)2.0对正常口腔黏膜、低危白斑、高危白斑、口腔早期鳞癌进行转录组学检测,基因本体论(GO)功能分析筛选出生物学作用为缺氧应答的基因和相关miRNA,并采用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测验证白斑缺氧应答基因和miRNA的表达。结果正常黏膜与低危白斑间有7个缺氧应答差异基因,低危白斑与高危白斑间有10个缺氧应答差异基因,高危白斑与早期鳞癌间有21个缺氧应答差异基因。缺氧应答关键基因低氧诱导因子1α、趋化因子配体2、基质金属蛋白酶3的mRNA和miR-21在正常黏膜、口腔白斑和早期鳞癌中的表达量均呈阶梯式升高,白斑与早期鳞癌之间的表达差异均具有统计学意义,这与转录组芯片结果基本一致。结论缺氧应答基因及相关miRNA参与白斑病癌变。