引起一起暴发性急性胃肠炎疫情的埃可病毒18型VP1基因特征分析

作     者：周健明 谢显清 方苓 金玉娟 曾汉日 李静媚 刘凤仁 李彩霞 李晖 刘渠 张勇 郑焕英 ZHOU Jianming;XIE Xianqing;FANG Ling;JIN Yujuan;ZENG Hanri;LI Jingmei;LIU Fengren;LI Caixia;LI Hui;LIU Qu;ZHANG Yong;ZHENG Huanying

作者机构：广东省疾病预防控制中心广州511430 深圳市龙岗区疾病预防控制中心深圳518172 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2021年第37卷第1期

页      面：133-139页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目(项目号:LGKCYLWS2018000009),题目:深圳市龙岗区手足口病分子流行病学及健康人群肠道病毒EV71型抗体水平研究 国家自然基金项目(项目号:81660280),题目:人肠道病毒交叉中和表位筛选及其嵌合病毒样颗粒疫苗的免疫保护性研究 “十三五”国家科技重大专项(项目号:2017ZX10104001),题目:基于全基因组的病毒网络化监测和溯源技术体系研究 

主　　题：急性胃肠炎 埃可病毒18型(E18) 分子进化 序列分析 

摘      要：埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)属于B组肠道病毒(Enterovirus B,EV-B),是引起病毒性脑膜炎的重要病原体。对2019年4月广东省深圳市龙岗区一起急性胃肠炎疫情进行病原学鉴定及病原基因特征分析。此次疫情共有26名患者,均以发热、呕吐、腹泻、腹痛为主要症状。从其中18名病例采集了18份肛拭子标本,采用实时荧光RT-PCR、病毒分离(RD细胞)和半巢式聚合酶链反应法以鉴定病原,扩增病毒全长VP1区,测序并进行系统进化分析。结果显示,18份标本中11份肠道病毒核酸阳性,其中8份为E18。病毒分离得到2株病毒,从肛拭子标本直接扩增得到的7条E18全长VP1核苷酸序列,核苷酸相似性为100%,与GenBank中E18参考株的核苷酸及氨基酸同源性分别为79.2%~96.4%和93.3%~99.3%;进化树显示,深圳龙岗E18分离株(GDSZ1902)归属由中国分离株组成的C2a进化分支,在其VP1蛋白中的底部环处发现一处特异的氨基酸变异(D200N)。从流行病学和病原学结果分析,E18是引起本次深圳市龙岗区急性胃肠炎疫情的主要病原,属于中国E18主要流行株的进化分支,这是我国首次发现E18引起急性胃肠炎疫情的报道。