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基于数据库中肺纤维化miRNA及肺癌mRNA芯片资料分析筛查肺癌的潜在治疗靶点

Screening potential therapeutic targets of lung cancer based on microarray data of pulmonary fibrosis miRNA and lung cancer mRNA in database

作     者:孙站兵 邓伟华 刘艳萍 谭滇湘 张朝晖 SUN Zhanbing;DENG Weihua;LIU Yanping;TAN Dianxiang;ZHANG Zhaohui

作者机构:南华大学公共卫生学院衡阳421001 衡阳市中心医院麻醉科衡阳421001 

出 版 物:《生命的化学》 (Chemistry of Life)

年 卷 期:2021年第41卷第1期

页      面:133-142页

学科分类:1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含:心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金项目(81573193) 湖南省自然科学基金项目(2020JJ4082) 

主  题:肺癌 肺纤维化 生物信息学 miRNA 

摘      要:肺癌严重危害人类健康,患者预后较差。肺纤维化是肺癌的危险因素之一,与肺癌的发病机制存在一定关系。肺纤维化中失调的微小RNA(microRNA, miRNA)在肺癌发生发展过程中发挥着重要作用。本研究使用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)中肺纤维化miRNA及肺癌mRNA的芯片数据,利用GEO2R筛选肺纤维化差异miRNA与肺癌差异基因、miRWalk预测miRNA靶基因、STRING分析互作关系、WebGestalt进行GO与KEGG分析、GEPIA分析基因对患者生存的影响,最终获得SNRPE、PIK3R1、ARHGEF6等潜在的肺癌治疗靶点。通过对这些潜在靶点的认识进一步了解肺癌的发生发展机制,为肺癌的临床治疗贡献新的思路。

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