文昌锥SRAP-PCR体系优化及有效引物筛选

作     者：孙秀秀 陈加利 杨立荣 云勇 戚华沙 郑道君 Sun Xiuxiu;Chen Jiali;Yang Lirong;Yun Yong;Qi Huasha;Zheng Daojun

作者机构：海南省农业科学院热带园艺研究所海南省农业科学院海南省热带特种经济植物种质资源创新利用重点实验室海南海口571100 

出 版 物：《西南林业大学学报（自然科学）》 (Journal of Southwest Forestry University：Natural Sciences)

年 卷 期：2021年第41卷第1期

页      面：39-46页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：海南省重点研发计划项目(ZDYF2018076)资助 2019年度海南省省属科研院所技术开发研究专项“热带特色经济植物种质资源收集、保存与评价”资助 

主　　题：文昌锥 SRAP 反应体系 引物 

摘      要：通过单因素试验和正交试验相结合,分析DNA、引物、dNTPs、Taq DNA聚合酶4种因素对文昌锥SRAP-PCR扩增结果的影响,优化建立文昌锥SRAP-PCR体系。结果表明:文昌锥基因组DNA浓度和dNTPs浓度过低或过高均扩增不出产物,而引物浓度和Taq酶用量的增加能提高扩增效率。在适宜浓度范围内,各个因素对文昌锥SRAP-PCR扩增影响大小依次为:引物=dNTPsTaq酶DNA;最优反应体系为:总体系为20μL时,DNA 20 ng,引物0.6μmol/L,dNTPs0.15 mmol/L和Taq酶4 U。经验证,该体系获得的扩增产物清晰、稳定;筛选获得45对有效性引物组合多态性好,可应用于SRAP分子标记技术在文昌锥资源研究。